刮板式薄膜蒸發器結垢輕則會影響它的運行效率，重則會造成蒸發器、換熱器、換熱管或者整套蒸發系統的堵塞，影響設備的正常運行，也可能導致設備停機或者停產。結垢是因為物料中所含有的大量雜鹽在蒸發濃縮過程中結晶，形成晶核附著刮板式薄膜蒸發器內壁，久而久之就會出現結垢現象，此類結垢有水溶性結垢、硬性結垢等，每種垢體的處理方式有所區別。

　　一、水溶性結垢。主要是指在不加洗滌劑的情況下，光用清水就基本可以洗除的污垢，稱為水溶性結垢垢。一般是溶解性無機鹽。水對于這類成分有良好的溶解力和分散力。

　　二、硬性結垢。主要是指水不溶性結垢，主要是鈣、鎂和硅等不溶性無機鹽，鈣結垢是主要的硬性結垢。對于這類硬性結垢一般采用化學除垢法，常規的水煮法不能有成效處理。在清洗過程中，H+-會對金屬機體產生腐蝕，并出現氫脆現象，因此清洗劑中要加入相應的緩蝕劑;溶解產生的Fe3+、Cu2+等氧化性離子會造成金屬機體的點蝕、鍍銅等現象，因此清洗液中還需加入掩蔽劑。

　　三、機械除垢法。一般采用動力鍋爐除垢用的電動軟軸刷管器進行處理，成效顯然，但是費時費力，嚴重影響項目的正常生產秩序，大大增加生產成本。

　　四、高壓水射流清洗。這種清洗方法就是將水流的壓力升到數10兆帕，乃至到了100兆帕以上，直接沖刷被清洗的垢層，將垢層擊碎以符合除垢的目的。